GLN �GLN GT�N.
`
`PRO PRO PRO
`SE,R SER SER'
`
`L!OU
`J,t�U l;t�U
`THR THF. THR
`PRO PRO .PRO .
`VAJ, VAL
`VA.Ii VA.L
`SEH ci.la
`Gl.!·l GLN
`THR THR
`
`Lt;U. ·lJl:.;lJ
`THR THR T.·,
`GLN GLN Gi
`PRO PRO St..
`PPO PRO PRU'
`SER SER SER
`glu VAL VAL
`«la
`.SER ?..l(l
`GLN GLN lv ...
`THR THR THR
`}1LA ALA ALA
`
`SER SSR
`
`PRO P?.O
`
`l.eu GLY
`
`VAL VAL VAT.·
`SER SER SF:!:<
`
`PF.O PF.O PRO
`
`GLY GJ,-f GLY·
`
`ALA AL.I\:
`
`va.• .1..:::,_t.)
`t� J:, �} Ll:.V Lt,U L!'..U .'.L�V Lt;IJ
`J_,::.u
`.1...:::.u
`.�.1.t:V
`:Tf!R
`TH'R
`Tl--i:�. THR
`TflR THH THR THR THB THR J'HR
`:j ll���l!��l����j���l�,
`GLN
`GLN
`GLN Gl1li
`GL'J GLN GJ,N GLN GLN GLN GLN
`�11 jii
`ala
`PHO
`PRO
`;.;.la
`PRO PRO PRO PRO PRO· PRO PROi
`·!�tJITT. �rf",X��:�w>·:·��K ··��rt
`PF.Cl
`PRO
`pp.'.)
`PF.O
`PF.C PRO PRO PRO PRO PRO PRO
`' ___ , --·--':·:...:.�--
`SER
`'3E��
`:"ER
`SER
`SEF\ SER SER SER SER SER SER
`
`' '·
`
`GIJY GLY
`asp asn
`
`ala
`
`GLY Gl,Y Gl1Y:
`his asp aap
`as:n asn
`;:;.sn-
`
`6 ·: PRO : PRO'
`0.:-t��·:%�f
`1 > .VAIJ "V�L·
`E .
` :nF. val·
`t<
`. ·:r'Y'F 'I'Y.R
`5$r. ph#.
`.!\RG. ·f�R.G,
`glu ilJ, �.1
`.� ���-�[�'
`PRO P1°'tl
`_ SEH .. SER.
`R
`r�!!! ��:
`ARG Af\G:
`. ·' GLU· ·t;pJ,
`·,_..
`·c;i,y GLY.
`.. SCR ::'{ET:\
`: PHE PRE
`S�lF-t. S..SH.·
`'sE:R .stR
`Sf!:C• ASH
`,'GLY. Gl,Y:
`:ala
`.A'3]\'!'
`THR THI',
`2'\LA A1:1.
`THR THF··
`. LEl� liEU
`··_nm THR · :·11£ EE
`7.Li
`h f�
`-GLN 'i;:lu' ·ser ALA'
`SER. th:c
`iti· ;;f
`·Tc· 79 SC
`: . .,;8.} -� -
`82
`GLU 'Gt.ti,
`. 83
`x�� iftr::
`A ALA A''I:\',
`j;y·� r1� iR TY.R TYR TYR riYR ;rY.R
`·f iR r:_ YH TYH
`r �-,;/ �� �' :t • . fit T1R
`,, .. ,,,
`;< . I'.R TYR TYH phe
`'l':rn phe 1YR
`·�'!R -iYl\9� � TlR TYR phe TYP. TYR TYR TYR TYR TYR TYR
`TYR
`'.l'YR
`-:-.� ·
`1iYR T�FR TY� ;.�� � ��-
`CYS
`',,:,- ,«'.,"fS -CYS (;YS CYS CYS
`CYS -l�:J '�-1 C'!S C:YS CYS CYS CYS CYS CYS CYS CYS cvs CYS CYS CYS
`�l;'h{
`1;YR :rYR 1fh�
`·�
`..
`·•,TRP TRP TPf1 $ Tne· ·p· a.l.Rt'-:ME� l"\\"t. 0k.&'JIRy1'JIRP ser thr TRP . · TRP val TRP TRP TR? TRP.
`'
`.-li•.•:./·
`:-€:fi;:;3t;;;y.�< .. ,".r- /;.�·:·/[f �t�· -�t� fffifC �t(--���--�h �£[�� ;:; �t� �ff��� ��� �t� ��i ;�� e�� -��Cf£�-��¥
`«•'.·.\�.\,:;.,.),.1i'RP .TRP
`q•)
`'· -- l)'J:t�> �Ji'; 171��1· r:lsp ;\SP J\S.P ASP ASP ASP JI.SP ASi' ASP t'.t•r
`. A'SP ASJ? :A�F. ASP ala ASY• "3.'""• A
`.. a.rg ... thr: gly gln SEP- SER gly gly a.la SER gly SEH SER thr ;,�11;
`SER_ - SER SER j{f.Jo HU�Att'SER'V1e�gisn SER. SER phe asn
`SER SER t:he . thr Sl:'.R
`SER
`. SER. S_ER' SER
`<ci��-
`: sEP..'-sER fy� mei; asn ££i ·
`;�.le
`c�,,�-�
`:,;;,;f,
`:;r;;l<, gly SER sE·R SER SER - SER SER p:ro
`:.3L1<.
`SER ile ���
`94
`SER 'g.l,;y h SER - thr
`SEP.
`95 .
`. 93
`. ::f?.UbliC ffEfalft1,(�!rYlce �tfi GLN ��� i{�
`1-1.rs
`.
`�t� ��� ti� ���
`m�
`·�1�tl PRo • .. ,. .. 7�� ""--
`Natronal lnstit�s��� �����'-:.==
`2�:i'·
`���
`-�-�
`4I�"r ;�,. :!!! �:�-�!r �rf/�� ����-*� ---�� -��-:t��-��� �E ��� ?�� m-���.· �tr·
`·�. :� -i�! ��
`100: · ..•... 2��1Yir-t
`GLY GLY (;J,Y GLY GLY THR Gl.Y G0.�YY;r:.G,,ff_!_'�gt} . gg gfi .·_gtl:-gg
`GLY·-_.-,
`GLY GLY. GLY Gf.,Y GLY GLY GLY GL'( GLY<>GLY: GLY GLY. GLY GLY GLY
`·:�I..X GLY GI,Y GL'f- GtY GLY
`GLY
`99
`GLYGI,Y GLY'·GLY.GLY GLY
`f
`.. ·.·.·.· .. -_.1.--.·····.··.-'rR".··�·.�.·-·�.·-•· .
`• .... l_ :_:.�_;:
`g£f
`. . THR-''.THR 'I'HR THR THR
`. �.:-: .. LI� ' .. �.---•.:.:::.ii •..•
`Ttm T.Hf-{ 'J'!IR' THR 'nm THR THif ;�f\.·�·.t:;t,
`106 ·1· Vlf/5, .... · "\/,.,
`��· . =: �i; :i: m ii� :�: �:� !ii �i� :ii
`i�g tir '�irm tir ti� t; ti8
`. . " LEU LEU LEU LEU
`105-'i THl� .J,, .
`.
`V'/'.J. V/\l, VAL VAL VAL VA.L VZ'.L ""�· VAL--· VAL ·,·VAL) Vfi.L VAL
`.
`: .
`'VAL Vl\L
`VAL
`. VAL. VAJ,
`- LEU/ llEU :!':itu'-.LEtr LSU LEU Lf:(.J
`u"�J LEU LEU LEU J,EU. LEU
`. '·
`. H36h ... - LEU ( .�}.;Jkt:
`LElJ
`TJJR.�TH!3'.' THR ·THR 'VT.f.-.rI·.:
`
`;rYR
`
`rRo
`
`1 of 51
`
`BI Exhibit 1055
`
`

`

`11111·11r1i1111�11·1111 �·111 r r11� ·11111111111·1111r111111111111111
`
`3 1822 00711 4820
`
`SEQUENCES OF
`PROTEINS OF
`IMMUNOLOGICAL
`INTEREST
`
`FIFTH EDITION
`
`v_ /
`/?'9/
`
`Tabulation and Analysis of
`
`Amino Acid and Nucleic Acid Sequences of Precursors,
`
`
`V-Regions, C-Regions, J-Chain, T-Cell Receptors for Antigen,
`
`T-Cell Surface Antigens, �2-Microglobulins,
`
`
`Major Histocompatibility Antigens, Thy-1 , Complement,
`
`
`
`
`C-Reactive Protein, Thymopoietin, lntegrins, Post-gamma Globulin,
`
`a2-Macroglobulins, and Other Related Proteins
`
`1991
`
`Elvin A. Kabat*, Tai Te Wu+, Harold M. Perryt,
`Kay S. Gottesman+, and Carl Foellel
`
`gy, r ni:�ticc:, ::mrl QpvekmmAnt. anri i\le1 ''""'".'""'! �"l.ncer Center/Institute
`of
`*Depts. of Microbiolo
`· :-rc;ity, New York, NY
`·
`
`Cancer Research, Collt:
`10032 and the National In.:... 1 c.
`'ice of the Director
`
`National Institutes of Health �th..
`
`. *
`
`+oepts. of Biochemistry, Molecular Biology, and Cell Biology, and Engineering Sciences and
`
`
`
`
`
`
`
`
`Applied Mathematics and Biomedical Engineering, Northwestern University, Evanston, IL 60208
`
`and the Cancer Center, �orthwestern University Medical School, Chicago, IL 60611
`
`
`
`tBBN Systems and Technologies, 1 O Moulton Street, Cambridge, MA 02138
`
`
`
`*Formerly with BBN. Present address Laboratory for Applied Research in Academic Information,
`
`
`
`
`William H. Welch Medical Library, The Johns Hopkins University, Baltimore, Md 21205
`
`The collection and maintenance of this data base is sponsored under grant 5ROi Al-125616 to
`
`
`
`
`
`E.A. Kabat of Columbia University by the following components of the National Institutes of
`Health, Bethesda, MD 20892:
`
`Office of the Director
`National Center for Research Resources
`National C�ncer Institute
`National Institute of Allergy and Infectious Diseases
`
`
`
`
`
`National Institute of Diabetes, Digestive and Kidney Diseases
`
`National Institute of General Medical Sciences
`National Library of Medicine
`
`
`Work with the PROPHET software package is supported by a subcontract from Columbia
`
`
`
`University to BBN Systems and Techologies, Cambridge, MA 02138
`
`U.S. DEPARTMENT OF HEAL TH
`
`AND HUMAN SERVICES
`
`Public Health Service
`
`National Institutes of Health
`
`NIH Publication No. 91-3242
`
`2 of 51
`
`BI Exhibit 1055
`
`

`

`,
`
`Our listing of sequences will be kept up to date. Investigators are
`invited to send additional sequence data when accepted for
`publication. Send two copies of the manuscript together with a
`letter of acceptance £rom a journal to:
`
`Dr. E.A. Kabat
`National Institutes of Health
`Building 8, Room 126
`9000 Rockville Pike
`Bethesda, Maryland 20892
`It would be extremely helpful if you can send us your sequence data
`on magnetic tapes or floppy diskettes or a clean copy of the
`sequences. The file formats should be such that they can be read by
`a generic word processor. If you have access to the internet you
`can send your sequence data to us via electronic mail to
`cfoeller@bbn.com or to tt@ttwu.esam.nwu.edu.
`
`When published, three reprints should be provided.
`
`If any published sequences have been overlooked or if any errors
`are found, please bring them to our attention.
`
`3 of 51
`
`BI Exhibit 1055
`
`

`

`TABLE OF CONTENTS
`
`INTRODUCTION • • . . . • . . . . . • • • • • • • • • • • • • • • • • • . . . . . . . . . • . • . . . . . . . . . • . . . . • . . . . . • . . . . • , . • • • • • • • • • • • . . • • • . . • • . xiii
`REFERENCES TO INTRODUCTION . • • . . . . . . . . . . . . . . • . . • • . . . . . • . . . • • . • • • • • . . • . • . . . . • . . . • • • • • • • • . . . • • . • • . • • • • • lxxiii
`
`SIGNAL SEQUENCES OF LIGHT CHAINS
`
`HUMAN KAPPA CHAINS • . . • • . . . . . . . • . . • . . . . . • . • . . . • • • • . . • '. • . . . • . • . • • • • • . • • . . . • • • . • . . . • • • . . • • • • . . • . . . . • . . . . 1
`
`HUMAN LAMBDA CHAINS • . . . • • • . • . . . . • . . • • . • • • • • • • • • • • • • . • • . . . . • . • . • . . . . • . . . . . • • • • . . . . • • . • . • . . . . . • • • . • . • • . 5
`
`MOUSE KAPPA CHAINS • • . • • . . . • . • . . • • • . • . . . . . • . • • . . . . . • • • . . . . . . . • • • . . • • . . . . . • . • . • . . • . • • . . . . . . . • . . . . • . . • . . 7
`MOUSE LAMBDA CHAINS • . . . . . . . . • • . • • . . . . . . . . • • • • • . . • • • • • • . . . . . • . • . . . . • . . . • • • . . . . . • • • • • • . . . . . . . • • • • . . . • . 1 7
`
`. • . • . . . • . . • • • . . . . . 19
`MISCELLANEOUS KAPPA CHAINS • . . • • • • • • . • . . . . . • . • • • . . . . . . • . . . . . . . . . • . . • . • . . . . . . . . • • . • .
`MISCELLANEOUS LAMBDA CHAINS . . . • . . • • • • . • • . . . . . . . . . . . . . . • . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . • . . • • • . . . . . . . . . • . . . . . . 21
`
`SIGNAL SEQUENCES OF HEAVY CHAINS
`
`HUMAN • . . . . • . . . • • . . . • • . • • . • . . . . . • . • • • . . . . . • . • • . . • . . . . . . . . . . . . • . . • • . . . . . . . . . . . • . • . . . . . . . . . . . . . . . • . • • . . 23
`
`MOUSE . . . . . . . . . . • . . . • . • . • . . . . . . . . . . • . • . . . . . . • . . . • . . • . • . . . . . . . . . . . . . . • . . . . . . . . . . . . • . • • • . • • • • • • • . • . • • • . 29
`
`MISCELLANEOUS . • • • • . • . • . • • • . . . • . . . . • • • • • • . . . . . . . . . . . . • • . . . . • . • • . . . . . • . . • . . • • • • • • • • • . . • . . . . • . . . . . • . . . . 40
`
`SIGNAL SEQUENCES OF T-LYMPHOCYTE RECEPTOR
`
`HUMAN ALPHA CHAINS . • . . . . • • • • • . • . . • • • • . • • • • . . • . . . . . . . . . . . . . . . . . • , . . . . • • . , • . . . . . . . . . • • • • . . • . . • • . . • . . • . 4 5
`HUMAN BETA CHAINS . . . • . • . . . . . . . . . • • • . . . • . . • . . . . . . . . • . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . • . • . . . . . . . • • . • • . . . . . • . . . . • 4 9
`HUMAN GAMMA CHAINS • • . . . • • • . . • . . . • • . . . . . . . . • • . . . . . • . • . • . . . . . . . . . • . . . . . . . . . . . . . . • . . . . • . • . • . . • • • • . • • • • . 53
`
`HUMAN DELTA CHAINS . . . . . . • . . • • . . • • . . . . . . . • . . • . . . . . . . . . • . . . . . . . • . . . . . • . . . . . . . • • • . . . • . . . • . . • : . • . . . • • • • • 55
`
`MOUSE ALPHA CHAINS . • . . • . . . . . . . . . . . . . • • . . . • • . . • . . . . . . . . . . • . . . . . . • . . . • • • • • . . . . . . • • • • • . . . . • • . . • • • • • . . . . 5 7
`
`MOUSE BETA CHAINS . • • . . . • • • • . . . • • • . . • • . . . . . . • • . . . . . . . . . . . • • . . . . . . • . • . • . . . . . � • • • . . . . . . . • . . • . . . • . . • . • . • 6 1
`
`MOUSE GAMMA CHAINS . • • . . • . . . . • . • • • . . . . . . . . • . • . . . . • . . . . . . . • . • . . . . • • • • . . . . . . . . . . • . • • • . • • • . . • • • • • • • • • . • • 65
`MOUSE DELTA CHAINS . • . • . . . . . . . . . . . . . . • • • . . . . . • . . . . . . • . • . . . . . • . . • . . . . • . • • . . • • • • . • . . • . . . , • . • . • . . . . • . . . . 67
`
`MISCELLANEOUS ALPHA CHAINS . • . • . • • • • • . • . . . . . . . • . . . . . . . . . . . . . . . . . • • . . . . . . . . . . • • • . . . . . • • . • . • . • • . • . . . • . . 69
`MISCELLANEOUS BETA CHAINS . . . . . • . • . • • . . . . . . . • . . . . . . • . • • • . . . . . . . . • • . • . • . . • . • • • . • • . • . • • . • • . . • . . . . . • . . • • 71
`
`SIGNAL SEQUENCES OF RELATED PROTEINS
`
`BETA-2-MICROGLOBULINS . • • • . • . . . . . . . . . . . . • . . • . . . . . • . . . . . . . . . . . . . . • . • . • • . . . . • . . • . . . . . • . • • . . . • . . • . . . . . • • 7 3
`
`MAJOR HISTOCOMPATIBILITY ANTIGENS CLASS I • . . . . . . . • . . • • . . • . • • . . • . . • • . . . . . . . . . . . . • • • • . . • • . • • • • • . • • • • • • 75
`
`I REGION ANTIGENS CLASS II . . . . . • • . . . • • • • . . . • • • . . . . • • . . . . • • . • . . • • . . • . • . • . • • . . • • . • • • . • . . . . • . • • . . • . • . • • 82
`
`COMPLEMENT . . • • • • • . . . • • • • . . . . • • • • • . • . . . . . . . . • • • . • . . • • • • . . . • . • . . . . . . . • • • . . . . • • • . . • . • • • • . . . . . • . • . . • . • . . 8 9
`
`T-CELL SURFACE ANTIGENS . . • . • • • . . . . • . . • • . . • • . . . . . . . . . . . . • . . • • . . . . . • • . . . . . . . . • • . . . • • • . • • • • . . . . • . • • • • . • 9 1
`
`INTEGRINS . . . • . . . • • • . . . . • • • . . . . . . . . , • • . . . . . • . • • . . . • • • • . . . • . . • . . . . . . . . . . • . . . . . . . • . . • . . • . . • . . • . . . • • • . . . 94
`
`MISCELLANEOUS PROTEINS • . . • . . • • • . . • • • • . . . . . . . . . . . . . • . . • • • . . • . • • . . • . . . . . • . . . . . • . . • . • . • . • . • . . • . . . . • • . • . 9 6
`
`VARIABLE REGION LIGHT CHAIN SEQUENCES
`
`HUMAN KAPPA CHAINS SUBGROUP I . . • . . • • • • • • . . • • • • . . . . • • . . . . • • • . • • . . . . . . . . • • . . . . • . . . • . • . . • • • • • , . • • • • • • . 1 0 3
`HUMAN KAPPA CHAINS SUBGROUP I I • . • . . . . . • . • . . . • . . . . . . . . . . . . . . • . . . . . • • . . . . . . . . . • . • . . • • • • . . • • • • • • . . . . • . 113
`HUMAN KAPPA CHAINS SUBGROUP III . . • . . . . . . . • . . . . . . . • • • . . • . . . . . • • . • . . . . . . • . • . . . . . • . . • • • • • • . . . . . . • • • . . . 1 1 8
`HUMAN KAPPA CHAINS SUBGROUP I V . . . • • . • • • . . . . . . . . . . • . • • . • • • . . . . • . . . . • . . . . • . • • . • • • • • . . . . . . • • • • . . . . • • • . 128
`
`HUMAN LAMBDA CHAINS SUBGROUP I . . . • • • • . . . . • • . . . . . . . . . . . . . . . . • . . . . . . . . . . . . . . • . . . . • . . . . . . • . . . . . • • . . • . • 131
`HUMAN L.>.MBDA CHAINS SUBGROUP II . • • • . • • • • . • . . . • . . . . . • . , . . . . . . • , • . . . . . . . . • . . . . . . • • . . . . . . . . . . • . . • • • • . • 1 35
`HUMF-.N LAMBDJI. CHAINS SUBGROUP III • • • • • • • . . . . . • . . . . • • . . . . • . • . • . . . . • • • . . • . . • • • . • . • . . . . • . . . . • • • • • • • . • • • 139
`HUMAN LAMBDA CHAINS SUBGROUP IV • . • • • . . • . . • • • . . • • . . • . . . . • • . • . • . . . • • . . . . . • . • . . . . • • . . . . . . . . • • . • . • • • • • . 1 4 4
`
`HUMAN LAMBDA CHAINS SUBGROUP V . . • . • • • . • . . . . • . • . . • • . . . . . • • • • • . . • . • . • • . . . . • • . • • . • • . . . • • . . • • . • • • . • . • • • 14 6
`
`HUMAN LAMBDA CHAINS SUBGROUP VI . . . . • • . . . . . . • . . . • • . . . . . . . • • • • . . • . • . . . • • • . • . . . . . • • . • . . . • • • • • • • • . . . . . . 14 8
`
`MOUSE KAPPA CHAINS SUBGROUP I • . . • • • • • • . . . . . . . . . • • . . . • . . . • • . . . . . . . . . . • . . . . . . . . . . . • • . • . • . . . . • • . . . • • . • 151
`
`MOUSE KAPPA CHAINS SUBGROUP II • . • . • . . . . . . . . . . . . . . . . • . . . : • . . . . . • • . . • . . . . . . . . . . . . . . . . . • • . • . • • • . . . • . . • 163
`
`MOUSE KAPPA CHAINS SUBGROUP III . • . • . • . • • • • • . . . . . . . . . . . • . • . . . • • . . . . • • . • . . . . • • . • • . • • . . • . . . • • • . . . • . . • • 1 9 0
`MOUSE KAPPA CHAINS SUBGROUP IV • . . . • • • • . . • . • • . . . . . . . • • . . . • • • • . . . . . . . . . . . . . • . . • . • • • . . . . • . . • • . . . . • • • . . 201
`
`MOUSE KAPPA CHAINS SUBGROUP v . . . • • • • • . • . . • • • . . . • . . . . . . . . . . . . . . . . . . • • • • . . . . . . . • . • . . • • . . . • . . • . . . • . . . . 2·os
`
`MOUSE KAPPA CHAINS SUBGROUP VI. . . . • . • . . • . • • • • . . . . . . . • • • . • . . . . • • • • . • . . . . • • • . . . • • . • • . • . • . . . . • . . . • • • . . 2 3 9
`MOUSE KAPPA CHAINS SUBGROUP VII. . . • . • • . • . . . . . . • • . . • . • . . . • • . . . . . . . • • • . . • • • • . . . • • • • . . . . . • • • • • . . • . . . . • 257
`
`MISCELLANEOUS MOUSE KAPPA CHAINS . . • • • • • . • . • • . . . . • . . • . • . . • • . . . • • • . . . . . . • . . • . . • . • . . • . • . . . . . . • • . . • . . • . 25 9
`
`MOUSE LAMBDA CHAINS . • . • • • . . . . . . • • • . • . . • . • . . . . • • . . . . . . . . . • . . • • . . . . • . . • . • . • . • . • . . • • . . . • • • • . . . . . . • . • • • 2 6 3
`
`R A T KAPPA CHAINS • . • . • • . . • . . . • . • • • • • . . . . . . . . . . . . . . . . . . . • . • . . . . . . . . . • . . . . • • • . . . . . . . • . • . . • . . • . . . • . . . . . 271
`
`RAT LAMBDA CHAINS • . . . . . . . . . • . • • . . • • . . • • . • . . . . . . . • • • . . • . . . . . • . . . . . • • . . . . . . • . . • • • . . . . . • • • • . • • • . . . . • • • 274
`
`RABBIT KAPPA CHAINS . . . . . • • • . • • • . . . • • . . . • • . . . . • • • • . . . . • • . • • . . . . . . • • • . .. . . • . • . . . • • . . . . • • • . . . • • • . • . . • . • 276
`
`RABBIT LAMBDA CHAINS . . • . • . • . . . • . • • • • • . . . • . . . • . . • . • • . • . . . • . . . . . • • . . . . . . • • • . . • . . • . . . . . . . . • • . . • . . . . • • . 290
`
`CHICKEN LAMBDA CHAINS . . • • . • . . . • . • . • • . • . • . . . . • . . . . . . . • • . . • • . . . . • . . . • • . . . . • • • • . . • . • . . • • . • . . • • • . • . . . . . 2 93
`
`MISCELLANEOUS KAPPA CHAINS • • • • . • • . . • • • . • . • . . . • • • • • . • • • . . . . . . . • • • • . . . • . • • . . • . . . • • • . . • . . • . • . • . • . • . • • • 303
`
`MISCELLANEOUS LAMBDA CHAINS • • • • • . . • • • • . . . • . • . • . • • • . . • . . . . . • . • . . . • . • . • . • . • • . • • • • . . . • • • • . • • . • . • • • • • • • 30 6
`
`MISCELLANEOUS LIGHT CHAINS . • • • • . • • • • . • • • . . • • . . . . . • • . • • . • . • . • . . . . • . . . . . . • • • • • • . • . . . . . . . • . . . • • • • • • . . . 3 0 8
`
`4 of 51
`
`BI Exhibit 1055
`
`

`

`TABLE OF CONTENTS (cont'd)
`
`VARIABLE REGION HEAVY· CHAIN SEQUENCES
`
`
`
`• . . .• . • . . .. • . .. . . . • . . . . • . . . . . . • • , • . . . •• . • . • . . . . . . . . • • • • •
`
`. . . • . • . . . . . . . . .
`
`
`
`• • .• • . . . . . . . . .. • . • . . . . . . • . • . .• . . . . .. . • • • . . . . . . • • . . • .
`
`
`
`. • • .. • . • •• • . . . . • . . • • • • • . . . • . . • . • . . . •• . . . . • • • • •• . •. • . . . • • . . .
`
`. . . . . . . . . . . . . .• • • • • . . . • . • . . . • . • . . . . . .
`
`• • . . . . .• . • . • • .• . • • •• • . • . • • . •
`
`• . . • . . .. • . • . . . . .. . . • . . . •. . . . • . . • . . . .. • .• . . . • • • . • . . •
`
`• . • . • • • . . . . • • . • • . • . . • . . . . . . • •
`
`
`
`. . • . • . . . • .. . . • . • . .. . . . . . . • . • • . . • .. . . • • • . . . . . . . . . . • . .
`
`HUMAN SUBGROUP I • . . • • .• . • • • . . .• • . . . . • . •• . • • . • . . •. . . • . .. . . . • • , . • . . • • • . • • • • • • • • . . • • . • • , • . • . , • • , • • . . • • 310
`
`
`HUMAN SUBGROUP II . • . . • • • . . . •• • •. . . • • • • • • . . . • •. • . . .. • • . •. • . • . . •. . .• . . . . . • • . • • •• • • • • • • • . . • . • • • • • . . • • . 317
`
`HUMAN SUBGROUP III • • . • . . • • . . . • • • . . . • • • . . • • . . • . • • . . . . . •. . • . • . .• • • • • . . . . . .• . • . • . . . • • • .• • • • • • • • •. • . • . . 324
`
`MOUSE SUBGROUP I (A) . . . • . . • •. . • •• . • • •• • • •• • . . . . . • . • .. • . . . . . . . • . . . . . . • .• • • • • . . • • • .• • . • .• . . • • • .• . •• • . 339
`MOUSE SUBGROUP I (B) . . . • • • • . . . • . • • • . .
`·, . , • • . 362
`MOUSE SUBGROUP II (A) . . • • . . • • . • . . . . • . . . . .
`. . . . . . .• . . . . . • . . . . . . .• . . . . . • • • •• • • . . •. • • • • . 375
`MOUSE SUBGROUP II (B) • . • . . . . . . . . • . . . . .
`• . • .. • . . . 398
`MOUSE SUBGROUP II (C) . • • • . •• . . • • . . • • . • . . .. . . . . . . . .• . • . . . •• . . . . . . . . . •• • • . • • . . • . • .• . • . . . •. . . . . • . , • • • • 421
`MOUSE SUBGROUP III (A) • . . • • . . • • • . • . . • . • .
`430
`MOUSE SUBGROUP III (B) . • . . • . .. . . • • . . . . . . •• . • . • . . . . • . . . • . • . • . . •
`451
`MOUSE SUBGROUP III (C) . • . . • • • . . • . . • • . . . • . . • . • . . .
`• • . .. . • • • • .. . .• . . • . . . . •. . • 458
`• . . . . . , . . . . . . . . . • . . . . . . . •
`
`MOUSE SUBGROUP III (D) . • . • . . • .• • . . . • • . . .• . . • . . .. • • . . . . . . • .. • • . · . . . . . . . . . .. • • • • . . •• • . • • .. . . • . • • . . • . . • 464
`
`MOUSE SUBGROUP V (A) . . • . . . . . .. • . . . . . • . • .. • . .• • .• . .. • . • . . . . . • . •. . . . . . . . . .. . . .. •• • . . • • . . . . • • . . . , • • • . . 4 7 5
`MOUSE SUBGROUP V (B) . • . . . . • . • .. . • • • •. . . .. • • . • . • . • . .. . . . . • • . . . . . • •
`, . . • . • 494
`MOUSE MISCELLANEOUS • . . . .. . • . • . . . • . • • . • . • . . . • . . . •
`4 98
`RAT • . . • • • . . . .• . •• . . . . • . . • • . • • . • . . . . • •
`• • . . • •• • . • . .• • . • • • • •. • . • . . . • .• . • . 512
`RABBIT . . . • • .. . • • . . . . . . . .. . • • . • . • . . . . . • • • . . . . • . .
`514
`GUINEA PIG . • . • . . • . . • . . . . .
`
`
`
`. • • •. . . .• . • . . . . . . . . . . . . • . .. . . . . . . . . . . • . . .• • . . . • . . . . . • . • . . . • . . . . • • . . . . . . • . .
`
`
`
`521
`
`CAT • • • • • • • . . . • • . . • • •
`
`- . . - . . . . - . . . • . . . .. .. • . . . . . . . . . . . . . .
`• • • . . • . . • • .
`• . . . . • • . • . . . . . • . • . • . . . • • . . . . • . . • .
`
`523
`525
`DOG . • . • • • .
`. . • . . . . • .. . . •• • • 527
`CHICKEN . • .. . • . . .• . . • • . • . . . . • • . •
`
`SHARK • • . . . . .. . • . . •. . . . • .• . •. • .. . • .. • . • .. • • . • . • • . .. . . . • . . . . • . .. . . . . . . . • . .• • . . . • • • .• . . • • • • • . . • • • . . . • . 530
`MISCELLANEOUS . . . . . • . . . • . • . . . . . . •
`533
`
`'
`
`
`
`
`• . • . . . . . • . .• . • • . . .• . . . . . . • . . . • • . . . .. • . . . . . • . • . • . . . .. • • . • . . • . . . . • . . •. . . . .• . . • . . • . . . . • . • . . .
`
`
`
`. . • . . • . . . . • • . . . • • • . •• . . . • • . • • . . .• • .. . . • . . . • . . . . . . • . . •
`
`• • • . . . •• . . . . . . • . • . . . . . • . . . . . . • • . . • • . . • . . . • . . . . . . . . • • • . • . • • . . . . . . . • .
`
`. . . . . •. . . . . . . • • • •• . • . . • . . • • . • . . . .
`
`• • • • • • • • . • • • • •• . . . . • • . • . . .
`
`• . . . . . . •• . . • • • • . • • . .. • . • • . • •. . • • . . . • . . • . . . . • .
`
`
`
`• • . • • . . . . . • . • . . . • . .. . • . • • . .. • • • . . . . . . . •
`
`• • . • • • .. . • • • . • . • . • •. . . • • • • • • . . . .
`
`
`
`. • • . . • . . . . • . • . . . •• . • • • • • .. • • . . . • . .• . . • . • . . . •• . • . • • . • .. • . • • . • • • . •
`
`
`
`. • • • • .. . . . • . • . . • . • • • . . , • . . . • . . •• . • . . • . . . . • • . . . . . • . .. . • • . • • • . . • • .
`
`
`
`. • • .• . •• . . . . . .. • . . . • . . . .. • . . • • . . • • • . •. • • . . .• . . • • • . • • •
`
`
`
`. • • • . . . . . . . . . • . • . . .• • • • • • . • • • . • . . • . • • . • •
`
`• . . . • . •• . • . • • . . . . . . . .
`
`VARIABLE REGION T-LYHPHOCYTE RECEPTOR (TCR} FOR Jl...NTIGEN
`HUMAN ALPHA CHAINS SUBGROUP I • . . . . . • . •• • • . .. . . . . . . . .• . . . . . . . . . . . .
`540
`; • . • • . . . . . •• • • . • • • • • •• • • • . . . • • . • • .
`HUMAN ALPHA CHAINS SUBGROUP II . • • .. . . . . . . . . • . • . . . . . . . . . .
`• • • . • • •. . . 543
`
`HUMAN ALPHA CHAINS SUBGROUP III . . .. • . . . • • .. .. • . . . . . . • . . . • . . . • . . • . . . . • . •• • •• . . . . • . • • .• .. . • . • •. • • • • • • 546
`HUMAN ALPHA CHAINS SUBGROUP MISCELLANEOUS . . . . . . • . • . . • . • . . • . . . . . . . • • . . • . • .
`548
`HUMAN BETA CHAINS SUBGROUP I • . . . . . • . . . . .• . . . • . • • • • . . . .
`552
`HUMAN BETA CHAINS SUBGROUP II . • . . •. • .. . . . . . . . . . . • . . . • • • . . . . •
`559
`HUMAN BETA CHAINS SUBGROUP MISCELLANEOUS . • • • • • • . . . . . . • . . . . . • . . . . . . •
`5 62
`HUMAN GAMMA CHAINS . • •. • • . . • . . • . . . • .
`566
`HUMAN DELTA CHAINS . . . . . • . . . . . . • . . . •
`570
`MOUSE ALPHA CHAINS SUBGROUP I. . . . • . . . • • . . . . • . .
`5 7 5
`MOUSE ALPHA CHAINS SUBGROUP I I . . • • • . • • • •. • •• . • • . . . • . • • • • • . .
`5 7 9
`MOUSE ALPHA CHAINS SUBGROUP III. . . . . •. • . . •. . . • . . . • • . . . . . • • • . . . . . .
`• . . • • . . •. . • . • 582
`MOUSE ALPHA CHALNS SUBGROUP MISCELLANEOUS • • . . • •. • . . • . • . .. . . . . , • . . • • • • • • .. . . .• • . • . .. • • • . • • •. • . • . • • . . 585
`
`MOUSE BETA CHAINS SUBGROUP I • . . • •. • . . • • • • • . • •• • . . . . • • . . • • . .• • • • . . . • • • . . • •• . . • • •• . . . . . • • . . . • • . . . . . . . 5 90
`MOUSE BETA CHAINS SUBGROUP II . • . • • . . . •• . • .• . . . • .. • • . . • . • • . . . . • . . . . •
`595
`MOUSE BETA CHAINS SUBGROUP III . . . . • • . . . . • • • . . . . . . • . . . . . . . . . . . • . . . . . •
`598
`. . . . . . . .. . . . . . · • • . . . . . . • . • . . • . . .
`. . .. . . • . .. . . . . . 600
`MOUSE GAMMA CHAINS • • . . • • . • • • .• • . • . . . . • • •. . .. • • • • . . . • . . . • . .. . . .• . . . . . . . . . • . . •. . • . • • . .• . . • . . .. . • • . . • . 611
`
`MOUSE DELTA CHAINS . . .• . . . . . . • . . . . . . .
`. . . . . . .. . . . . . . . .. • . . . . • • .. . • . . •. • • • • • . . • . 616
`RAT ALPHA CHAINS SUBGROUP II . •• . • . . • . . . . . . . . . • • . . . . . • • • . . • . . . . . . .
`. . . . .• • . • . . •• . . . • • 628
`
`RAT BETA CHAINS SUBGROUP I • . . . . •• • • • . • • • . . • •. • . . . . • • . . . • •. . . .. • . . . . . • . . •• • . .. . . .. . . • • . .• • • . . . . . • • • • 630
`
`RAT BETA CHAINS SUBGROUP II • • . . . • • . • . .• . . . • . • • . . •• . . . . . . • •. . . . • . • • .• • . . . . . . • . . • . . . .. • . . . . . • . . . . . •• . 632
`
`RAT BETA CHAINS SUBGROUP MISCELLANEOUS . . . . . . . . . . . . • . . . . . • • . . • • • . . . . . . . . . • • . . • . • • • • . . . . • •• • • •• • • • • • . 634
`RABBIT ALPHA CHAINS SUBGROUP I . . .. • . . . . • . . . • • .. . •. . . . .. . • .. • • . • • • . • • . . . .
`636
`RABBIT BETA CHAINS SUBGROUP I . . . •. • • . • . • • . . . . . . . • . . . . . • • • . . •
`• • • . . • . .. • . •. . •. . . . . . . 638
`
`BOVINE ALPHA CHAINS SUBGROUP I . . •. • .. . . . • . . . • . . • . . • . . . . . • • . . . . • . . . . .• • . . . • . . .• . . .. • . •. . . . . . . . • . . •. . 640
`BOVINE ALPHA CHAINS SUBGROUP III . . • . . . • . . . • . . • . . . . • • . . . • • • . • . • . .
`642
`BOVINE ALPHA CHAINS SUBGROUP MISCELLANEOUS . . . • .• • . . . • . . • . • • • . . • . .
`• • . . . • . .• • 644
`
`MOUSE BETA CHAINS SUBGROUP MISCELLANEOUS • • . • • • . . . • • • • . • • • .
`
`• . . • • • . . . • . • . • • . . • . . • • • • . . • • . . . •
`
`. . . . . . . • • . . • • • . . . . . . . . . . . . .
`
`. . . .. • . . . • • . . . . . . . . . . .
`
`. . . . . . . . . . • • . . . .
`
`. • . • . • , • . .• . . . . . . • . . . . • • . • •
`
`. . • . • . . . . . • . . • . . .
`
`, . . . •• . . • • . . . • . . • . . . • . • . . . . . . • • • • . .
`
`. . • • . .• . .• • . . • . . . . . . . . . .
`
`CONSTANT REGION SEQUENCES
`647
`Kl\PPA LIGHT CHAINS • • •• . . . . . . . • . . .. . . • • • • •. . . .. . . .• . • . . . . . . . • . • • . . .
`LAMBDA LIGHT CHAINS • • . . . • • • • • .. . . • •. • • . . . . . • . •. . • . . • . . . . •• . . . • • • • • . .. • • • • • . . . • . . • . . . .. . • . .• . . . • . • • . 653
`
`661
`HEAVY CHAINS CHl REGION • . . •. . . • • • • • .• • . . • . • • • • • • . • . . . . .
`670
`HEAVY CHAINS HINGE REGION • • • • . • • • . . . • . .• • • . . . • . . . . . . . . . . . • . . . . . . .
`67 9
`HEAVY CHAINS CH2 REGION • . . • • • . . . • .• • • • •. . . . . . •. . . .• • • • . . . . . . • . . • . . • • • . . . . . • . . . .
`688
`HEAVY CHAINS CH3 REGION • • . • • . • • • •• • . • • . • . . . . • • . . . • •
`
`HEAVY CHAINS EXTRA LONG CH3 REGION • • • . . •. • . •• • . . • • • . • . • • • . . . . . . . . • . • . . • • • • •• • . . . . • . . •. . • • .• . • • • . • • . 697
`
`HEAVY CHAINS CH4 REGION • • • • • • • • • • • • • • • • • • . . . . . • . • • •• • • •. • . • . . . .. • • • • . •• . • . • . .. . • • . . •• • • . .• • • • • • . • • . 700
`HEAVY CHAINS EXTRA LONG CH4 AND MEMBRANE BOUND REGIONS ............ . ..... ... . ....... . ..... . . . . ... . . . 709
`
`• • .. • . • . . .. . • • . . • . . • •• • • • •• • • . . . . . • . • • • • • . . •
`
`. . • . • . • • . • •. . • . . . • . . • • • • . • . • • • . • • •
`
`. . • • •• . . . • .. • . • • • • • • •
`
`
`
`. . . . . . . • • . . . •. • • • . . . • . . . . • • • • .• • • . • . • .• • . • • • • . • •
`
`• . . • .• . . . • . .. . . . . .• • • .. . • • . . . . . . •
`
`5 of 51
`
`BI Exhibit 1055
`
`

`

`TABLE OF CONTENTS (cont'd)
`
`MAJOR HISTOCOMPATIBILITY ANTIGENS CLASS I SEQUENCES
`
`HUMAN A-LOCUS OF THE ALPHA-1 REGION • . . . . . . . . . . . • . • . . • . . . . . . . • . • . • . • . • . • • . . . . . • . . . • • • • . • • • • • • • • • • . . • 724
`
`HUMAN A-LOCUS OF THE ALPHA-3 REGION . • • • . . • . . . . . . • "· • . . . . • • . . • • • • • • . • . . • . . . . . . . • • • • . . • • . • • • • • • . . • . • • 730
`
`HUMAN A-LOCUS OF THE MEMBRANE REGION • • • • • • . . • • • • • • • • • . • • . • . . • • • • • . • • . • . • • • • . • . . • • • • . • • • • • • • • • • • • • • • 733
`
`HUMAN B-LOCUS OF THE ALPHA-1 REGION . • • • • . . . • . . • • . . . • . . . • . . . • . . . . • • • . • • . • • • • • . . • • • • • • • • . • • • • . • • • . • • • 738
`HUMAN B-LOCUS OF THE ALPHA-2 REGION • • • . . • • . • • . . • • . . • • . • . • • • • • • • . • • • • • . • • • • . • • . . • • • • • • . • . • . • • • • • • • • • 741
`HUMAN B-LOCUS OF THE ALPHA-3 REGION • . • . . . • • . . • • . . • • . • • . . • . • . • . . . . . • • • • • • • • . . • • • . • • • • • • • • . • • . • • • . • • . 744
`HUMAN B-LOCUS OF THE MEMBRANE REGION • • . • . • . • .
`. • . . . . • . . • . . . . . • • . . . . • . . • • . . • . • • • • • • • • . • . • • • • • • • • • • . . . 7 4 7
`
`HUMAN A-LOCUS OF THE ALPHA-2 REGION . • . • . . • • • . • • . . . • • . . . . . . • • . • . . • . • . • . . • • • • . • • • • • • . , . . . . . • . • • . • . . • . 727
`HUMAN A-LOCUS OF THE CYTOPLASMIC REGION • • • . • . . . . . • . • • . . • , • • . • • • • . • • . • . • . • • • • • • • • • • • • . • . . . • • • • . • • . . . 7 35
`HUMAN B-LOCUS OF THE CYTOPLASMIC REGION • . . • . . • . . . • . • • . . . . • . • • • . • . • • . . . . • . . • • . . . • . , • • . • . . • • • • . • . . • . . 7 4 9
`HUMAN C-LOCUS OF THE ALPHA-2 REGION . • : • • • . • . • . • • • • . . . . . . . . . . • • . . • • • • . • • •